内分泌代谢病科成立于1987年，是重庆市糖尿病强化治疗中心、重庆市老年医学研究中心、重庆市重点学科、重庆医科大学临床药理机构内分泌专业组和重庆医科大学第二临床学院内分泌专业硕士-博士授予点。
全科拥有专科医生21名。其中有专业技术二级教授，享受国务院特殊津贴1人，重庆市学术技术带头人及重庆市学术技术带头人后备人选各1人，院学科带头人2名。现有教授5名、副教授/副主任医师6名，博士后指导教授1人、博士导师2名、硕士导师6名、全国面创治疗师2名。国家认证糖尿病专科护士7人，高级营养师2名，糖尿病造口伤口专科护士资格2人。科室现有渝中、江南院区共计床位100余张。
内分泌代谢病科配备有专门的内分泌临床实验室和科研实验室，可测激素达数十余种。
开设门诊包括: 内分泌代谢病门诊、生殖内分泌门诊、肥胖症门诊、骨质疏松症门诊、糖尿病足门诊、标准化代谢管理疾病门诊等多个专科门诊，在糖尿病及其慢性并发症、甲状腺疾病、糖尿病足、生殖内分泌疾病及肥胖等方面能够为患者提供高水平专业化的治疗。
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